اكدت مصادر سودانية ان  رئيس المجلس العسكري الانتقالي السوداني الفريق عبدالفتاح البرهان و الذي كان مسؤولا عن القوات السودانية في اليمن رفع تقرير سابق الى البشير قبل عزله واصفا حرب اليمن بأنها غلطة.

وبحسب المصادر السودانية فانه في عام 2018 زار الفريق البرهان القوات السودانية في عدد من الجبهات ، وتأثر بما تعانيه هذه القوات من جراء مقتل عدد كبير من الجنود ، وفقدان الجيش السوداني مئات الجنود الذين تركتهم قوات التحالف السعودي قتلى في الجبال والأودية والسواحل ، الأمر الذي زاد من تدهور معنويات الجنود السودانيين ، وضعف أدائهم ، وعدم قناعتهم بأن الهدف من مشاركتهم في هذه الحرب هو الدفاع عن أراضي الحرمين الشريفين ، على نحو ما كان يردده الرئيس عمر البشير.

وعند عودته إلى الخرطوم كتب الفريق عبدالفتاح البرهان تقريرا الى القيادة العامة للجيش السوداني قال فيه بشجاعة ووضوح أن هذه الحرب ليست حربنا وكانت غلطة ، وطالب بسحب القوات السودانية من اليمن ، وفحص الجانب القانوني للاتفاق الموقع بين الحكومة السودانية والحكومة السعودية بهذا الشأن ، وعرضه على القيادة العامة للقوات المسلحة.

وكان الناطق باسم المجلس الانتقالي العسكري السوداني اكد انه سيتم مراجعة بعض الاتفاقيات الإقليمية والدولية ، والتأكد من مدى قانونيتها وخدمتها لمصالح الشعب السوداني، كما اجرى المجلس الانتقالي السوداني استفتاءا أوليا على حسابه الجديد في تويتر ، حول مشاركة الجيش السوداني في الحرب على اليمن ، تمهيدا لاستفتاء آخر يجري الإعداد له بالتنسيق مع تجمع المهنيين والمكونات السياسية في السودان.

وتشارك القوات السودانية في الحرب التي اعلنها ولي العهد السعودي محمد بن سلمان على اليمن والتي ادت لمقتل الاف المدنيين اليمنين وتركت الملايين منهم على حافة المجاعة.